勞務派遣公司應根據(jù)納稅人的區(qū)別應用不同的稅務征收政策。

一、勞務派遣不同納稅人的征收政策

般納稅人提供勞務派遣服務，可以按照《財政部 國家稅務總局關(guān)于全面推開營業(yè)稅改征增值稅試點的通知》（財稅〔2016〕36號）的有關(guān)規(guī)定，以取得的全部價款和價外費用為銷售額，按照一般計稅方法6%計算繳納增值稅；也可以選擇差額納稅，以取得的全部價款和價外費用，扣除代用工單位支付給勞務派遣員工的工資、福利和為其辦理社會保險及住房公積金后的余額為銷售額，按照簡易計稅方法依5%的征收率計算繳納增值稅。 小規(guī)模納稅人提供勞務派遣服務，可以按照《財政部 國家稅務總局關(guān)于全面推開營業(yè)稅改征增值稅試點的通知》（財稅〔2016〕36號）的有關(guān)規(guī)定，以取得的全部價款和價外費用為銷售額，按照簡易計稅方法依3%的征收率計算繳納增值稅；也可以選擇差額納稅，以取得的全部價款和價外費用，扣除代用工單位支付給勞務派遣員工的工資、福利和為其辦理社會保險及住房公積金后的余額為銷售額，按照簡易計稅方法依5%的征收率計算繳納增值稅。

納稅人選擇差額征收以后，36個月之內(nèi)不能變更，所以納稅人提供勞務派遣服務，不允許按照不同的勞務派遣合同，一部分選擇全額納稅，另一部分選擇差額納稅。

二、納稅人選擇差額納稅應同時具備以下條件

1、 勞務派遣行業(yè)是需要憑資質(zhì)經(jīng)營的，因此納稅人需經(jīng)其主管人力資源社會保障行政部門許可并取得《勞務派遣經(jīng)營許可證》，并在資質(zhì)的有效期限內(nèi)從事勞務派遣業(yè)務；未經(jīng)許可，任何單位和個人不得經(jīng)營勞務派遣業(yè)務。

2、 扣除的項目需要合規(guī)才能進行扣除：代用工單位支付給勞務派遣員工的工資、福利和為其辦理社會保險及住房公積金。

（1） 勞務派遣單位應當依法與被派遣勞動者訂立2年以上的固定期限書面勞動合同。

（2） 勞務派遣單位應當依法與用工單位就派遣勞動者數(shù)量、勞動報酬、社會保險費數(shù)額、項目名稱等事項簽訂勞務派遣協(xié)議或合同。

（3） 勞務派遣單位按照國家規(guī)定和勞務派遣協(xié)議約定，每月通過銀行等金融機構(gòu)為勞動者發(fā)放工資與相應福利；為被派遣勞動者繳納社會保險費和住房公積金憑證的復印件及由納稅人加蓋公章確認的注明繳納人員、繳納金額、繳納期間的明細表。

三、勞務派遣差額開票實務

1、納稅人采用一般計稅方法，既可以開具增值稅普通發(fā)票，也可以開具增值稅專用發(fā)票；

2、納稅人采取差額征收方式的三種開票方法：

（1）通過增值稅發(fā)票管理新系統(tǒng)中差額征稅開票功能開具增值稅專用發(fā)票，“稅率”欄將自動打印“***”，開具時在差額開票功能下填寫開票總金額和差額部分即可。

（2）通過增值稅發(fā)票管理新系統(tǒng)分別開具發(fā)票：就差額扣除后的余額部分開具增值稅專用發(fā)票；就差額扣除部分開具增值稅普通發(fā)票，開具增值稅普通發(fā)票時稅率選擇為0，稅額為0。 （3）通過增值稅發(fā)票管理新系統(tǒng)全額開具增值稅普通發(fā)票。在增值稅普通發(fā)票的票面分別開具扣除金額和扣除后的金額，稅率均為5%：申報時，對應填寫附表一,1、2、3、4、12、13、14列，通過12列實現(xiàn)差額扣除，同時填寫附表三）

注意：由于開票方式選擇的不同，各地稅務局針對一般納稅人的清卡也會有不同情況，選擇第二、三種開票方式不存在異常清卡的狀況；選擇開票系統(tǒng)的差額開票功能可能會自行清卡失敗，需要納稅人到稅務局做異常清卡的工作。所以，要結(jié)合當?shù)囟悇站值那闆r慎重選擇開票方式，省去不必要的麻煩。